つまらない内容ですが「頂点の位置を揃える」でXYZの最小値の表示がZの値を参照しているみたいなのでご確認願います。
あと「頂点の位置を揃える」の「新しい位置」の幅の表示が足りなくなる場合があるので少し広げられたほうが良いと思います。
Metasequoia Ver4.0 Beta5 (64bit&32bit) is running.
Windows version : 6.2 (Windows 8 x64)
Number of CPU : 8
Physical memory : 32662 MB
Direct3D11 Driver: NVIDIA GeForce GTX 660
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Number of CPU : 4
Physical memory : 8174 MB
Direct3D11 Driver: NVIDIA Quadro 600
2013-09-12 21:08