Pythonのimportが動作しません。
同じフォルダにscript1.py、module1.pyを置いて実行した場合、
スクリプトパネルに"script1.py"を読み込んだ場合：　正常に実行される（module1.pyが読み込める）
スクリプトパネルに"script1.py"を読み込んでいない場合（既にツールパネルに登録済みで実行した場合）：　importで読み込めない（module1.py）

<code name="script1.py">
import sys
sys.path.append('.')

import module1
</code>

スクリプトと同じフォルダのパスをPySys_SetPath、またはPyRun_SimpleString(上のようなコードで)、exec(boostの場合)、などで設定してもらえないでしょうか？