mqoデータです。バージョンは4.2.4です。

>特定の構造のポリゴンでエッジの追加で辺を作るときに指定したところと違う場所に辺が作られることがあります。

同じ面を共有している辺が２つ以上あると結果がおかしくなることがあるようです。
次のリリースで修正します。