現状メタセコでは、スムージングがオブジェクト単位でしか行えません。
そのため一部分だけスムージングを掛けるということができず一部だけ細かくしたいのに全体のポリゴンが分割されてしまうためものすごくポリゴン数が増えてしまいます。
Mayaや3dsMaxでは、選択した面にスムージングをかけるということができるので同じようなことができないでしょうか。

http://download.autodesk.com/global/docs/maya2013/ja_jp/index.html?url=files/Mesh__Smooth.htm,topicNumber=d30e156135