4.4.0の凹凸テクスチャパスの不具合に関連した不具合だと思いますが、作業中にデータを保存したときにエラーメッセージが出ました。バージョンは4.4.1です。
一部ですが出力された内容を貼ります。

Failed to load a texture image 'C:\Users\●●●\AppData\Roaming\tetraface\Metasequoia4\Bump\V(0,1,0);'.
レンダリング中にエラーが発生しました。(OpenGL)
モジュール'Metaseq.exe'のアドレス0047BDB3でアドレスA25E0D8Cに対する読み込み違反が発生しました。

ボーン機能、「ペイント」の「頂点」でウェイトを設定している時、ctrl＋zで元に戻そうとするとクラッシュします。

ボーンのリギングでスナップ機能を使ってポリゴンの頂点に一致してボーンを並べようとしたときに僅かにずれて配置されてしまいます。
頂点に吸着しずらく動作自体もぶれるように動くことがあり怪しいところがあります。
吸着する範囲を広めにして正確にスナップされるようにしてほしいです。

PMDファイル保存に関しましてご質問いたします。
ファイルを保存する際、６４bit版のメタセコイア４（バージョン４．４１）でPMD保存ができなくなりました。
「できなくなりました」というのは最初にバージョン３導入した際はプラグインによるものなのかPMD保存が可能だったのですが、最近アップデートをした際に急にできなくなってしまいました。
３２bit版ですとPMD保存は可能なんですが、原因がわかりませんのでご報告申し上げます。

次に、「ボーン」の「スキニング」などに関して、
レンダリングエラーが頻発して画面が暗くなってしまいます。保存はそのまま可能なのですが、原因がわかりません。
マシンスペック不足による物なのかわかりませんが、ベンチマークテストは２９０９．２４というスコアになっております。
ソフト側の不具合なのかマシンスペック或いは取り扱っているデータの大きさの問題なのか教えて頂けますようお願いします。

UV操作画面にて面を選択コマンドで選択し、それを解除しようと
何もない場所をクリックをしたのですが解除にはならないのですがどうやれば
よいでしょうか？
CTRLを押しながらでも解除できなく、面を形成している頂点を
CTRL押しながら選択すると解除できるのですが

こんにちは、現在の最新バージョンのmetaseqのインストールバージョンを使っています。
metaseqのショートカット設定をバックアップしておきたいのですが
保存しておくファイルは
。。。Roaming\tetraface\Metasequoia4_x64/
の中にある「Metaseq.setting.xml」であっていますでしょうか？

IKの回転制限が一部機能しないことがあるみたいです。
サンプルデータのhito-mmd.mqoで股の回転制限を全ての軸で0にして動かないように、
膝を一つの軸だけ動かせるように設定してから脚をIKで動かしてみると動かないはずの股の関節が捩るように回転することがあります。

ボーンにZ軸のフィンがついていますが、この部分もスナップできるようにしてほしいです。
ポリゴンの流れに沿ってローカル軸を設定したいことがありますので。

以前のバージョンではUV操作パネルの「面」を選んでいれば、UV上の頂点を操作出来ましたが、
今回のバージョンではできなくなっておりました。
不具合でしたご対応を、仕様であれば以前のように「面」状態でも頂点の操作ができます様、
ご検討お願い致します。

左上の点辺面簡前と配置されているボタンのところで　点　辺　面の透明度を調整
できる機能が欲しいです
仮に、　面のボタンを一秒長押しするとスライダーが現れて透明度を調整できる、ボタンを放すとスライダーが消える　　同期ボタンの隣辺りに透明度をリセットボタンを追加し、そのボタンでリセットする

といった具合の機能があると裏側の辺や点を選択しやすくなるなど、モデリング作業がより快適になるかと思います

是非検討お願いします