次のような感じで呼び出してください。
s = MQSystem.openSetting("hogehoge")
s.save("value",123)
print("value:" + s.load("value"))

save()で格納した値は最終的にMetaseq.setting.xmlに出力され、次回起動時にも適用されます。

ありがとうございます。
できれば、ヘルプファイルの方へも反映していただけると助かります。

すみません。
今理解したのですが、基本的にメソッドがクラスメソッドになっているのは、MQSystemのメンバだけなんですね。