こんばんは。創作活動おつかれさまです。

ご質問のプラグインについて、Metasequoia4　ver4.7.0（32bit）での動作が確認できました。
こちらのプラグインに限らず、Metasequoia ver3.1以前向けのプラグインを使用する際は、基本的に32bit版が前提となるようです。

64bit版で同等動作を行おうとする場合、スナップ機能（辺）を使って手動で整列…という少し手間な方法しか思いつきません。（始点・終点を結ぶ辺を新たに生成（別obj推奨）し、その辺へ整列したい中点をスナップ移動する）

ご参考になれば幸いです。
不足・誤り等ございましたらご指摘ください。

返信ありがとうございます。
32bit版なら使えるんですね、参考にします

スナップ機能一度試してみたいと思います、内容を読む限り手間が大きそうですが慣れたら案外いけるかもしれないのでしばらくはその方法でいじってみます!