改めまして、以前マルチUVの要望を投稿した者です。今回はご採用いただき誠にありがとうございました！
早速触ってみたところ、リリースノートに記載の内容と異なる部分がございましたので報告させていただきます。
Windows 10　Metasequoia 4 Ver4.8.5a EX版にて確認しています。

https://www.metaseq.net/jp/archives/2487/
Ver4.8.5のリリースノートに

 >ファイル入出力については、独自形式(mqo/mqoz)以外には、glTF(glb)とFBXの2種類のファイル形式で複数UVチャンネルに対応しました。

上記の記載があったのですが、FBX出力/FBX読込に対応していないような気がします。
mqozは出力/読込できました。glTFは扱ったことがない為試しておりません。
 
①MetasequoiaでUV1・UV2を設定した3DモデルをFBXモデルにて出力
② ①のFBXモデルをMetasequoiaで読み込む
③ ①のFBXモデルをblender（他社ソフト）で読み込む

上記を行ったところ、②③共にUV1のみの状態で読み込まれた為、FBX出力時にマルチUV情報が消えているようです。

また、他社ソフトで出力したUV1・UV2をもつFBXモデルMetasequoiaに読み込んでもUV1のみの状態になってしまった為、読み込みも正常に行えていないようでした。

厚かましく申し訳ございませんが、こちらも何卒ご検討いただけましたら幸いでございます。