欲しい機能として説明不足だと思いましたので、
具体的に追加して欲しい機能を補足させて頂きました

<ボーン階層移動で欲しい機能>
現状は階層移動操作として、『同階層の先頭に移動』はありますが、以下もあると助かります

・『階層を一つ上に移動』
・『階層を一つ下に移動』
・複数選択して親にしたいボーンにまとめてドラッグ、
　『その下に階層の子も移動しますか？』と確認
 『はい』なら子の階層もまとめて移動、
『いいえ』なら選択した単体のみ移動(子階層はそのときの親階層に残す)

ボーンの階層組み換えは「ボーン設定」内からだとおっしゃる通りに面倒です。

分離されているボーンを親子関係にしたい場合、「ボーン設定」からもできますが、それよりも「追加」で親にしたいボーンからドラッグして左ボタンを押したまま、子にしたいボーン上でさらに右クリックするほうが簡便にできます。

切り離す場合はボーンリスト上での右クリックメニューからできるので、順序の入れ替え以外はボーン設定を開く必要がなくなります。

お世話になっております、ご回答ありがとうございます。

教えていただいたとおり、『追加』がオンの時、既にあるボーンを拾って右クリック階層アタッチできること、確認出来ました！

単にボーン追加するための機能なのかと思いましたが、既にあるボーンを拾って階層ごとドラッグ出来るとは知りませんでした…
オブジェクトメニューの階層操作と統一して欲しい気持ちはありますが、解決で問題ございません。

教えて頂き、ありがとうございました。

>教えていただいたとおり、『追加』がオンの時、既にあるボーンを拾って右クリック階層アタッチできること、確認出来ました！

訂正
"既にあるボーンを拾って階層ごとドラッグ出来る"と思ってましたが、
右クリックで吸着できた点は良かったですが、階層1番上のボーンが結合されて無くなってたことに気づきました…

こちらの機能、ボーン操作ウィンドウにある『移動』のときは『階層移動(親階層を結合せず)』だと要望通りだと思いましたので訂正させていただきます。
お手数おかけしますが、ご検討よろしくお願いします。

「移動」では右クリックで２つのボーンを結合できますが、ドラッグしたほうがなくなりなるので、親子関係のみを変えたい場合には使用しません。
両ボーンをそのままに親子関係の構築のみをしたい場合は「追加」を使用します。
同様に、兄弟関係にあるものを親子に変えたい場合やその逆も、子ボーン側をいったん「子ボーンを切り離す」してから、「追加」で親子にします。

>「移動」では右クリックで２つのボーンを結合できますが、ドラッグしたほうがなくなりなるので、親子関係のみを変えたい場合には使用しません。
>両ボーンをそのままに親子関係の構築のみをしたい場合は「追加」を使用します。
>同様に、兄弟関係にあるものを親子に変えたい場合やその逆も、子ボーン側をいったん「子ボーンを切り離す」してから、「追加」で親子にします。
ご指摘を受け色々触ってましたがどうやっても接続できず、骨を１つづつバラバラにしてようやく理解しました！

結論としては…
骨を消さずに親子関係を付け直すことはできました。
なかなか接続出来なかった理由は、親から子へドラッグしないと接続出来ないことが分からず、いつも子を親にドラッグしてたのが理由となります。

いつも子からドラッグしてた理由として、Mayaの場合は子→親の順に複数選択してペアレントしてたこともあり感覚的に逆だったのと、既に構築済みの素体などは動かしたくないのもありました…

また、3D上で複数の骨が密集してる場合(例として補助骨など親子で回転軸を同じ位置にしてる場合)、意図せず他の骨に親子付けされてしまったり、ズレて新規で骨が追加されてしまうことも多々あり、感覚的にも煩わしく不便でしたので、スナップ先に『骨』もあるとミスって追加される心配はなくなると思いました…

やはり階層ウィンドウで親子付け出来るように、ボーンリスト階層上でもドラッグして階層移動出来た方が確実で、尚且つストレスなく親子付け出来ると思いましたので、ご一考よろしくお願いいたします。

Ver4.9.0bでボーンリストでもなるべくオブジェクトリスト同様に操作できるよう
・ドラッグ＆ドロップで親子付け・兄弟の順序入れ替え
・左右ボタンで親子付け
に対応しました。
少し操作が違う部分もありますが、だいぶ扱いやすくはなったのではと思います。