その現象は最初から発生していたのでしょうか?
あるタイミングで発生して以後の使用時にも継続して発生しているような場合では設定ファイルを破棄することでリカバリーできることがあります。
インストーラー版であればmetaseq.setting.xmlを、zip版ではmetaseq.iniを捨てることで次回の起動時に設定ファイルが作り直されます。
このときにリカバリーできている、捨てた設定ファイルを戻したときに再現性がある、ということであれば何かの拍子に設定ファイルが破損したことに起因するトラブルということになります。

返信ありがとうございます。
さっそく設定ファイルを破棄してみます。

最初から発生していた現象ではなかったように思います。
が、気が付くとそうなっていました。
フォルダ内のmetaseq.setting.xml、metaseq.ini　ともにひとつずつ破棄してみても
両方一度に破棄してみても、解決されませんでした。
もしや完全にインストールをし直しても継続されてしまうのでしょうか・・・？

アンインストール　→　再ダウンロード　→　再インストール　を行ってみましたが
それでも継承されてしまいます。

ほとほと困り果てております・・・

これ以上はなんともいえないですがインストールをやり直したほうがよさそうですね。
ダウンロードの過程でのファイルの破損も考えられるので新しくダウンロードしたファイルでインストールしてみてください。
確認するべきこととしてver3.1.3以前では正常なんでしょうか。
あとはメモリの空きは十分に確保されていますか?
実際の空きメモリよりも使用するメモリが多いと動作が不安定になった記憶があります。

返信ありがとうございます。
メモリは十分に余裕があります。
インストールのやり直しをやってみましたが、継承され続けています。

少し疑問が生じましたが、完全消去から再インストールをしたのに、ユーザー登録を
確認すると、すでに情報が入っていました。
ということは、ファイル以外の何かが消去されていないということでしょうか？

書き忘れました、3.13以前では正常でした。
現状での3.13での確認は、事象が下位にも継承されてしまうので不可能なのですが。

>書き忘れました、3.13以前では正常でした。
>現状での3.13での確認は、事象が下位にも継承されてしまうので不可能なのですが。

3.1.4ではマウス周りの処理が変わっていないこと、また今現在で3.1.3でも同様の現象が起こるとなると、
使用バージョンは関係しておらず、たまたま3.1.4を使い始めた時期と同じ頃に起きた変化が影響しているのではないかと思います。

バッファロー製のマウスは弊社内にはないため検証ができず詳細がわからないのですが、
Microsoftやロジクールなどのマウスをお使いの場合だと、マウスのボタンに任意の操作を割り当てるユーティリティーソフトが付属しており、
これが中ボタンの挙動に影響を与えることがあります。
また、ほかにもマウスジェスチャーなどを行う常駐ソフトがインストールされているなら、これも影響が考えられます。
もしこれらのソフトをお使いの場合は、それらのソフトの設定を変更したりユーティリティソフト自体をアンインストールするなどして動作を確認してみてください。

返信ありがとうございます。
マウスユーティリティやマウスジェスチャーはインストールや設定は行っておらず、
USBポートに挿してデフォルトのまま使用しています。
ためしにバッファロー製以外のマウスに挿し変えましたが同じ結果でした。
無関係かもしれないレジストリのクリーンアップもしましたが、以下同文です。

ユーティリティの類ではないとすると、あとは違うとは思いますが何かプラグインを入れていれば
それが影響する可能性もないことはないと思います。

あと設定ファイルについてはアンインストール・再インストールしても以前のものが残るので、
C:\Users\(ユーザー名)\AppData\Roaming\Metasequoiaフォルダ内にあるMetaseq.iniを直接削除してください。

中ボタンが離されたことがMetasequoia本体に通知されないためだと推測されますが、
根本的な原因がわからず、同様の現象についての報告も他にはないため、
対策などはっきりしたお答えは難しい状況です。

PC側のUSBポートの接触不良の可能性はどうでしょうか。他のポートに挿し変えて動かせますか。
あと現象は何時頃からでているんでしょうか。最近であればシステムの復元で変更が加わる前の状態に戻すことで解決できるかもしれません。

返信ありがとうございます。
プラグインは今のところデフォルトのままです。
はじめから入っている「ダミー」というのは関係ないでしょうし・・・

メタセコイアはDドライブにインストールしているせいか、教えていただいた
C:\Users\(ユーザー名)\AppData\Roamingの中には Metasequoiaフォルダは
存在しないようです（常に設定は隠しファイル表示にしてあります）。
一度ユーザー登録の消去をして再インストールしてみるべきでしょうか？

返信ありがとうございます。
マウスの挿し変えと同時に他のUSBポートにも移してみましたが、どこも同じでした。
現象としては、昨年あたりから起こっています。
今までは簡素なモデルしか作成してこなかったので何となく済ませてきましたが、
最近になってそこそこ作り込む作業が出てきたため、時間効率に支障が出始めたので
質問させていただきました。
システムの復元も、やはり数回試しましたが、さかのぼれる期間には既にこの事象は起こっていました。

ちょっと考えてみましたが、登録情報の削除後、Dドライブからアンインストールして
Cドライブに再インストールすれば直りそうでしょうか。
帰宅後、やってみようと思います。

>ちょっと考えてみましたが、登録情報の削除後、Dドライブからアンインストールして
>Cドライブに再インストールすれば直りそうでしょうか。
>帰宅後、やってみようと思います。

AppData\Roaming下はデフォルトのProgram Filesにインストールした場合となります。
Dドライブにインストールしているなら、設定ファイルはインストール先のMetaseq.exeと同じフォルダにあると思いますので、
どのフォルダに保存されているか位置をご確認ください。

返信ありがとうございます。
と同時に、思いのほか長くなってしまって申し訳ありません。

インストール先のMetaseq.exeと同じフォルダにある設定ファイルは、mqouserさんから[3577]で頂いた返信通りに直接破棄してみましたが、
[3581]の通り解決しませんでした。
もう少しあがいてみて、どうしてもダメならOSから再インストールも
やむなし、とも思えてきました（失笑）

直りました！！！！
ありがとうございました、OSは再インストールせずに済みました！！

要因を書くのを忘れてました。
タスクバーの一番右端に旗アイコンがありますが、その中を見た時
Panel.exe
Optic Mouse With Tilt Wheel
というのが立ち上がっていると発症するようで、右クリック → exit を選択すると
直ります。

しかし・・・毎回PC立ち上げる度にこの操作をすると思うと・・・