こちらは私のPCで起きている不具合ですが、
添付画像のように、接続されている辺のはずなのにまばらに開いた辺を強調表示の色になっている辺があります。
この現象が起きてる箇所の面を選択すると、元の表示に戻ります。
辺や頂点自体はちゃんと接続されています。

これはVer4.5.4でも起きていましたが同じ現象が続いています。

Metasequoia 4 Ver4.5.5 (32bit) is running.
Windows version : 6.1  (Windows 7)
Number of CPU : 8
Physical memory : 16351 MB
Direct3D11 Driver: NVIDIA GeForce GTX 970
    DeviceID: 5058
    SubsysID: 913904728
    Revision: 161
    FeatureLevel: 11.0

ご確認と修正対応よろしくお願い致します。