4.6（Mac）の試用中に再現性のあるクラッシュが発生しました。mmdボーンを設定してスキン設定→OKをクリックするとクラッシュします。ボーンを設定後、保存してアプリを終了し、再度起動してスキン設定すると回避できました。クラッシュレポートは取得していますが、添付機能が利用できないので添付していません。
お役にたつかどうかわかりませんが、一部転載しておきます。
Process:               Metasequoia [12102]
Path:                  /Applications/Metasequoia.app/Contents/MacOS/Metasequoia
Identifier:            com.tetraface.Metasequoia
Version:               4.6.8 (18)
Code Type:             X86-64 (Native)
Parent Process:        ??? [1]
Responsible:           Metasequoia [12102]
User ID:               501

Date/Time:             2018-12-13 23:59:29.157 +0900
OS Version:            Mac OS X 10.14.2 (18C54)
Report Version:        12
Anonymous UUID:        4FA55B23-F7F4-7D5B-A604-841733E1DDFB

Sleep/Wake UUID:       C9C5A516-914A-49B1-B52C-DEBDF5BCA258

Time Awake Since Boot: 410000 seconds
Time Since Wake:       43000 seconds