LhaplusのバージョンはVer1.5.3でしょうか？
このバージョンでは拡張子が二重（ファイル名に'.'が二個以上）になっているファイルがあると
エラーとして警告表示されるようになっているようです。
該当ファイルはreadme.jpn.txtとreadme.eng.txtの２つだと思いますが、
エラー表示が出るだけで解凍は正しくできていませんか？
Lhaplus自体、次のバージョンではこの警告表示を限定的なものにとどめるようです。

使用していたLhaplusのVersionは1.2.6です。
エラーが出ていたのはMetaseq.exeやdllを含む5ファイル程で、
アーカイブが壊れていると出て、解凍できていませんでした。
今までのzipファイルと何が違うのか、不思議ではありますが、
1.5.3を使用したところ、正常に解凍できるようになりました。
お騒がせいたしまして、すみませんでした。