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材質設定で透明マッピングを設定しても、3D画面に反映されないのです。
Q&Aに載っている、表示の2箇所チェックはして、表示はopenGLにしてもだめです。
ハードは、XPpro　C2D　2.4G　メモリ2G　Geforce7900GS　ドライバ最新

しかし2ndマシンのXP　home　GeforceFX5900XTで全く同じ作業をすると、
ちゃんと透明化されるので操作自体は間違ってないと思います。

最初と同じハード構成で正常に動いている方いらっしゃいますか？。
よろしくです。