はじめまして。
Metasequoia 2.4b21においてオブジェクトの回転でフリーズします。
サンプルのbody.mqoで説明しますと、「本体」「耳」を編集可能状態にした状態で「本体」を現物選択したあと回転させようとすると固まってしまいます。
どうやら回転させるオブジェクト以外で編集可能状態のものがあると回転で固まるみたいです。
他のmqoファイルでも同様です。Ver2.3.4では起こりませんでした。b18では起こっていなかったような気がします。
ちなみに「モジュール'Metaseq.exe'のアドレス00649ABDでアドレス00000008に対する読み込み違反が起きました。」というメッセージが表示される場合があります。

私の環境だけかもしれませんが一応報告させて頂きます。
OS:WinXPsp2
ﾒﾓﾘ:320MB
ﾋﾞﾃﾞｵｶｰﾄﾞ:ELSA GLADIAC 511 PCI 32MB
DX:DirectX9.0c