内容修正: 1、2、3 Light で別の数値で設定が困難になります。

追加情報: Metasequoia の再実行したときに、ライトの設定が保持される場合、いただければ幸いです。

Ambientはシーン全体で1つですが、Lightの色は別々に設定されます。
上にあるスライダーはAmbientの値なので、光源の色とは別のものですが、
プレビュー用の球体にはAmbientとLightの両方の色が合成されて表示されます。

そうですね。Metasequoia を実行し、モデル化するたびに、1、2、3 Light を毎回設定する必要があります。
Metasequoia を再起動しても、一度設定1、2、3 Light 値が永続的に保持する機能がある場合は、いただければ幸いです。

また、Startup File を導入しても大丈夫だろうという気がします。