こちらの環境でも再現しました。
縫い合わせボタンを押した後数秒フリーズしてから落ちますね。
metasequiat側でエラーログが保存されていない上にデータのバックアップもできていませんね。

不具合確認いたしました。なるべく早期（可能なら数日内）に修正版を用意したいと思います。

自動バックアップは確実なものではなく、エラーの原因によっては動作しないこともあるようです。何か良い対策があるといいのですが・・・

Metasequoia　4.6　64bit でも、UVの縫い合わせを使うとメタセコイアが異常終了します。