ウィンドウが画面外に飛び出てしまって見えなくなることがないよう、スクリーン内に完全に収まっていることが前提となります。
ウィンドウの端が少しでも外に出ているとその状態は復元されずデフォルトの位置・サイズが適用されるようになっています。

>ウィンドウが画面外に飛び出てしまって見えなくなることがないよう、スクリーン内に完全に収まっていることが前提となります。
>ウィンドウの端が少しでも外に出ているとその状態は復元されずデフォルトの位置・サイズが適用されるようになっています。

返信いただきありがとうございます。
最初の投稿で環境など書いていなかったので下記詳細です。

OS：Windows10 Home / 64bit版
metaseq：Ver4.7.7b(32Bit)
画像解像度：2560 x 1080 px

返信頂いたあとで色々位置やサイズを変更して試してみました。
いずれもはみ出さずに試したのですが、横幅は割と広げても反映されました。
縦幅については反映されない場合が多かったように思います。

以前に投稿した者ですが、最新版(Ver.4.3.2）にアップデートしたところ、無事にウインドウサイズや位置を記憶してくれるようになりました。
意図せず解決できた感じですがご報告まで。

すみません、4.3.2ではなく4.8.2の間違いでした。