Spin3Dというのは何でしょうか？と思いましたが、そういうソフトがあるのですね。初めて知りました。

一般的な話でいうと、
・データの不備（どこかに亀裂、穴があるなど）
・そのソフトがその構造を扱えない
のどちらかと思いますが、他社製のソフトの挙動についてこちらに聞かれてもわかりかねますので、そのソフトの開発元へお問い合わせください。